一站式柱式miRNAout
產(chǎn)品及特點(diǎn) 本產(chǎn)品是在天澤基因miRNAout (CAT#:70501)基礎(chǔ)上開發(fā)的柱式升級產(chǎn)品,是目前外市場上快速簡單的小RNA分離純化產(chǎn)品。它具有下列特點(diǎn):
1. 一步法直接分離純化小RNA,比兩步法(先分離總RNA和再純化其中的小RNA)和PAGE電泳回收法更簡單。得到的小RNA長度大部分在200 nt以下,包括5S RNA、tRNA、miRNA、Pre-miRNA、pri-miRNA、siRNA、shRNA和snRNA等。
2. 柱式操作,比miRNAout更加簡單快捷,整個(gè)過程只需要十多分鐘。
3. 適用范圍廣,可以用于動(dòng)物組織、血液、植物等各種實(shí)驗(yàn)材料。
4. 小RNA純凈,OD260/280一般都在1.9以上。
5. 產(chǎn)率一般為20-40 ug/100 mg動(dòng)物組織,10-30 ug/100 mg植物組織。
6. 無基因組DNA的污染。
7. 可用于RT-PCR、miRNA標(biāo)記、microarray等后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
規(guī)格及成分 成 份 50次包裝
溶液A 25 mL
溶液B 25 mL
溶液C 50 mL
離心吸附柱 100套
通用洗柱液 50 mL
RNA洗脫液 10 mL
使用手冊 1份
運(yùn)輸及保存 常溫運(yùn)輸,4℃保存,有效期一年。
自備試劑 氯仿。
使用方法 由于離心吸附柱的吸附量限制,本產(chǎn)品每次提取只能處理100mg左右的各種組織,可以在1.5 mL塑料離心管中。如果處理樣品量大,請分成很多相當(dāng)于微量提取的量進(jìn)行,后再收集在一起。
1. 新鮮配制裂解液。將溶液A和溶液B按1:1的比例混合,然后根據(jù)組織細(xì)胞類型的不同分為下面及種情況使用。注意:溶液A和溶液B混合后必須立即使用,不要放置,否則會產(chǎn)生沉淀。
a) 對貼壁細(xì)胞:吸盡培養(yǎng)液,在每10平方厘米細(xì)胞中加入1 mL新鮮配制的裂解液,用槍輕柔吹打數(shù)次,確保細(xì)胞全部裂解。
b) 對懸浮細(xì)胞:離心收集細(xì)胞,吸盡液體,在每1-5×106懸浮細(xì)胞中加入1 mL新鮮配制的裂解液,用槍輕柔吹打數(shù)次,確保細(xì)胞全部裂解。如果是fibroblasts或carcinoma cell,1 mL新鮮配制的裂解液的細(xì)胞使用量不要超過1×106個(gè)細(xì)胞。
c) 對新鮮的動(dòng)物組織:先將剪切成小塊新鮮組織或液氮保存的組織放入10 mL或15 mL塑料離心管中,每50-100 mg組織加1 mL新鮮配制的裂解液,用勻漿器勻漿30秒左右。對肝、脾、胰、腎等細(xì)胞分裂十分旺盛的組織(細(xì)胞中含大量正在復(fù)制的DNA),建議組織的使用量不要超過50 mg/ mL裂解液,否則十分容易產(chǎn)生DNA污染。
d) 對新鮮的植物組織:先將剪切成小塊新鮮組織或液氮保存的組織放入10 mL或15 mL塑料離心管中,每50-100 mg組織加1 mL新鮮配制的裂解液,用勻漿器勻漿30秒左右。
e) 對RNALOCKER保存動(dòng)物或植物組織:先用紙吸去RNALOCKER液體后再剪切成小塊,放入10 mL或15 mL塑料離心管中,每50-100 mg組織加1 mL新鮮配制的裂解液,用勻漿器勻漿30秒左右。
2. 將裂解物轉(zhuǎn)移至一個(gè)干凈的1.5 mL塑料離心管中,然后加入0.2倍體積的自備氯仿(1 mL裂解物需0.2 ml氯仿),振蕩器上充分振蕩混均30秒。
3. 12000-15000 g室溫離心3-5分鐘。
4. 將上清液(約0.6-0.8 mL)轉(zhuǎn)移到一根離心吸附柱中以去除大RNA(標(biāo)記以跟后面要用的專門吸附小RNA的另一離心吸附柱區(qū)別開來,本試劑盒提供的離心吸附柱之間沒任何區(qū)別,可以隨機(jī)選一個(gè)做大RNA吸附,另一個(gè)做小RNA吸附)。注意:離心后下層有機(jī)相和中間層含有DNA和蛋白質(zhì),避免觸及,否則將產(chǎn)生蛋白質(zhì)和DNA污染。為保險(xiǎn)起見,可以留下100 uL上清液不取。同時(shí)吸取上清時(shí)緩慢進(jìn)行,否則容易吸出交界面的不可見的絲狀DNA。
5. 12000-15000 g室溫離心半分鐘,收集管中的穿透液。大RNA及DNA將與離心吸附柱的膜結(jié)合,小RNA將存在于穿透液中。但由于離心吸附柱的zui大吸附能力為40 ug動(dòng)物RNA,20 ug植物RNA,如果樣品中的大RNA含量高于上面數(shù)值,則穿透液中將同時(shí)含有大RNA和小RNA,在此情況下,穿透液需要再次重復(fù)上柱以去除大RNA。由于此時(shí)離心吸附柱已經(jīng)吸附了大RNA,所以需要預(yù)處理(具體步驟見本手冊后的附錄)。
6. 在后得到的不含大RNA的穿透液中加等體積的溶液C,混勻。此時(shí)溶液的總體積約1.5 mL。
7. 先轉(zhuǎn)移約0.75mL到一新的離心吸附柱中。注意:不要使用已經(jīng)使用過的、用來吸附大RNA的離心吸附柱。12000-15000 g室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。
8. 將上步上柱剩余的樣品轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,12000-15000 g室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。
9. 加0.7mL通用洗柱液到離心吸附柱中,12000-15000 g室溫離心半分鐘,棄穿透液。
10. 加0.3mL通用洗柱液到離心吸附柱中,12000-15000 g室溫離心半分鐘,棄穿透液。此步一般可以省略。
11. 12000-15000 g室溫離心半分鐘以甩出殘聯(lián)液體。此步十分重要,否則殘留的通用洗柱液會影響miRNA的使用。
12. 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到一自備的RNase-free收集管中,加入50-100 uL RNA洗脫液。
13. 12000-15000 g室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為miRNA樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
附錄:
1. 將結(jié)合有大RNA和DNA的離心吸附柱中加入0.1mL自備的超純水, 12000-15000 g室溫離心半分鐘,棄收集液。
2. 再加0.1mL自備的超純水,重復(fù)上步一次。
3. 將第5步的得到、需要進(jìn)一步去除其中大RNA和DNA污染的穿透液直接上柱,12000-15000 g室溫離心半分鐘,收集穿透液(此穿透液含小RNA)。
4. 如果大RNA已經(jīng)去干凈,可以直接進(jìn)入第6步;如果大RNA沒有去除干凈,則用本附錄1-2的方法處理離心吸附柱,然后再將此穿透液加入(接本附錄第3步)。一般樣品只需要額外處理一次就可以去除全部的大RNA污染。