目前色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀在分析儀器中具有重要地位。由于色譜儀的色譜柱具有的分離能力，把物質(zhì)按保留時(shí)間大小進(jìn)行分離，然后通過(guò)與標(biāo)樣保留時(shí)間進(jìn)行對(duì)比的方法確定物質(zhì)性質(zhì)，因此對(duì)未知樣品很難定性分析。而質(zhì)譜儀是直接測(cè)定物質(zhì)的質(zhì)量數(shù)與電荷的比值（m/z）在定性分析方面既準(zhǔn)確又快速。把色譜與質(zhì)譜聯(lián)合起來(lái)使用，色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀型式試驗(yàn)實(shí)際上是把質(zhì)譜儀作為色譜儀的一個(gè)通用檢測(cè)器來(lái)使用。
色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀基本工作原理
為了質(zhì)譜儀器的正常工作，必須要組成高真空系統(tǒng)的真空室。儀器使用了高性能的渦輪分子泵與前級(jí)真空泵構(gòu)成兩級(jí)真空機(jī)組以確保所需的真空。被分析樣品經(jīng)毛細(xì)管柱分離，進(jìn)入離子源。采用電子電力標(biāo)準(zhǔn)配置（EI），產(chǎn)生正離子，在推斥、聚焦、引出電的作用下將正離子送入四桿系統(tǒng)。四桿在高頻電壓與正負(fù)電壓聯(lián)合作用下形成高頻電場(chǎng)，在掃描電壓作用下，只有符合四場(chǎng)運(yùn)動(dòng)方程的離子才能通過(guò)四桿對(duì)稱中心到達(dá)離子檢測(cè)器，再經(jīng)離子流放大器放大，產(chǎn)生質(zhì)譜信號(hào)。得到了質(zhì)譜圖，通過(guò)解釋譜圖或進(jìn)行譜庫(kù)檢索以識(shí)別未知樣品的組成。
色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀組成部分
（一）、真空系統(tǒng)：
2級(jí)真空：
機(jī)械泵和渦輪分子泵
機(jī)械泵一般時(shí)前級(jí)真空，也就是在機(jī)械泵把真空降到一定水平后才啟動(dòng)渦輪分子泵，以保護(hù)分子泵。所以儀器從大氣壓到真空合適的狀態(tài)一般要經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的。
（二）、進(jìn)樣系統(tǒng)：
從分離裝置來(lái)的組分（氣體或者液體）或者從直接進(jìn)樣桿進(jìn)液體或者固體樣品。
（三）、離子源
離子源： 主要作用是使欲分析的 樣品實(shí)現(xiàn)離子化，尤其是中性物質(zhì)帶上電荷。
樣品本身性質(zhì)的差異，決定了離子化的方式不能有的離子源，離子源的類型也是多種多樣。
（四）、質(zhì)量分析器
質(zhì)量分析器是質(zhì)譜儀的核心部件，因此常以質(zhì)量分析器的類型來(lái)命名一臺(tái)質(zhì)譜儀。
( 五）、檢測(cè)器：目前是光電倍增器應(yīng)用較廣。
( 六）、采集數(shù)據(jù)和控制儀器的工作站。 
色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀應(yīng)用范圍
1、應(yīng)對(duì)各種突發(fā)事件，如有害物質(zhì)泄漏、重大環(huán)境災(zāi)害等。
2、凡是需要?dú)庀嗌V儀進(jìn)行檢測(cè)的場(chǎng)合，特別是對(duì)未知樣品進(jìn)行定性分析的地方。
3、反恐斗爭(zhēng)、禁毒緝毒、爆炸物品分析等。