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新聞中心

大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取實(shí)驗(yàn)

發(fā)布時(shí)間:2020-07-27瀏覽次數(shù):1177返回列表

實(shí)驗(yàn)方法原理:

堿法提取主要是利用共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒與線性染色質(zhì)在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們。在堿性pH環(huán)境,DNA變性,當(dāng)恢復(fù)中性并在高鹽離子濃度時(shí),大多數(shù)質(zhì)粒DNA可以準(zhǔn)確復(fù)性,留在上清中;而線性染色體DNA不能準(zhǔn)確復(fù)性,相互交聯(lián)纏繞附著在細(xì)胞壁碎片上與蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀。離心后獲得大量質(zhì)粒的上清液,利用親水性有機(jī)溶劑(乙醇、異丙-醇、PEG8000)使質(zhì)粒DNA脫水,離心后收集。

實(shí)驗(yàn)材料 :含質(zhì)粒的大腸桿菌

試劑、試劑盒:葡萄糖 EDTA Tris-HCl NaOH SDS KAc 異戊-醇

儀器、耗材:臺(tái)式高速離心機(jī) 恒溫振蕩搖床 高壓滅菌鍋 振蕩器 微量移液器 1.5ml離心管



一、試劑配制

1. LB液體培養(yǎng)基。

2. 100 mg/ml氨芐西林儲(chǔ)存液:稱取25g的氨芐西林粉末,加去離子水至250ml,完全溶解后過濾、分裝,20℃保存。

3. 溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖溶液,25 mmoi/L Tris-鹽酸(pH 8.0),10 mmol/L EDTA(pH 8 0)。1 mol/L Tris-鹽酸(pH 8.0)12.5ml,0 5 mol/L EDTA(pH8.0)10ml,葡萄糖4.730g;加去離子水至500ml,高壓滅菌,貯存于4℃。

4. 溶液Ⅱ:0.2moI/L 氫氧-化鈉溶液,1% SDS(10 N 氫氧-化鈉20 μl,10%SDS 100μl,加去離子水至1ml),使用前臨時(shí)配制。

5. 溶液Ⅲ(pH 4.8):5 mol/L 醋酸鉀300ml,冰醋-酸57.5ml,加去離子水至500ml,4℃保存。

6. 苯-酚:氯-仿(1:1,V/V)(酚和氯-仿均有很強(qiáng)的腐蝕性操作時(shí)應(yīng)戴手套?。?。

7. 無水乙醇。

8. 70%乙醇。

9. RNase A(20 mg/ml)溶液:100 mg RNA酶干粉加5ml超純水溶解,然后在沸水煮

15min,分裝,20℃保存。

10. TE緩沖液:10 mmol/L Tris-鹽酸(pH8.0),1 mmol/L EDTA(pH8.O)。

二、實(shí)驗(yàn)方法

1. 挑取LB固體培養(yǎng)基上生長的單菌落,接種于2.0ml LB(含Amp 100 μg/ml)液體培養(yǎng)基中。37℃、250 r/min振蕩培養(yǎng)過夜(約12——14h)。

2. 取1.5ml細(xì)菌培養(yǎng)液倒入離心管中,4℃、6000轉(zhuǎn)離心30s,棄上清,將離心管倒置于紙巾上,去除殘留液體。

3. 菌體沉淀重懸于100μl用冰預(yù)冷的溶液Ⅰ中,劇烈振蕩,使菌體分散混勻,室溫下放置5 min。

4. 加入200μl新配制的溶液Ⅱ,蓋緊管口,快速溫和顛倒離心管5——10次,以混勻內(nèi)容物,冰浴5min。

5. 加入150μl預(yù)冷的溶液Ⅲ,蓋緊管口,溫和顛倒5——10次混勻,冰浴3——5min,4℃、6000轉(zhuǎn)離心5min。轉(zhuǎn)移上清到一個(gè)新的1.5ml Ep管中。

6. 加入等體積的酚一氯-仿抽提劑,振蕩混勻,4℃、6000轉(zhuǎn),離心2 rain。

7. 小心移出上清于1.5ml Ep管中;加入2倍體積用冰預(yù)冷的無水乙醇于室溫沉淀雙鏈DNA,混勻,室溫放置2--5rain,4℃、6000轉(zhuǎn)離心5min。

8. 棄上清,將離心管倒置于紙巾上使所有液體流出,加入1ml 70%乙醇,蓋緊離心管顛倒數(shù)次,4℃、6000轉(zhuǎn),離心2min。

9. 去除所有的乙醇溶液,將管倒置于紙巾上使液體流盡,室溫干燥5——10min,直到乙醇都揮發(fā)干凈。

10.將質(zhì)粒DNA沉淀溶于50 μl TE緩沖液(含20 μg/ml RNaseA)中,溫和振蕩數(shù)秒,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?br />
注意事項(xiàng):

1. 溶液Ⅰ與溶菌液充分搖勻,用力適當(dāng)。因?yàn)榇藭r(shí)細(xì)菌還沒有與堿和SDS作用,染色體DNA尚未釋放,不必?fù)?dān)心其分子斷裂,一般可用力振蕩幾次。

2. 加入SDS后則要注意不能過分用力振蕩,溫和混勻,但又必須讓它反應(yīng)充分。

3. 加入溶液Ⅱ混勻之后,一定要在冰上放置,不要搖動(dòng),對(duì)于溶液Ⅲ同樣處

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