DNA探針變性液由北京百奧萊博供貨并提供相關(guān)技術(shù)服務(wù)支持，本品僅用于生物化學(xué)研究方面，我公司的DNA探針變性液品質(zhì)上佳，經(jīng)過多年的開發(fā)生產(chǎn)，已然非常成熟，歡迎廣大新老客戶訂購。...

特別提示：包括DNA探針變性液在內(nèi)，本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實驗，嚴禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途！

產(chǎn)品名稱：DNA探針變性液
英文名稱：DNA Probe Denaturation Solution
產(chǎn)品貨號：BTN131208
產(chǎn)品規(guī)格：10mL

雜交反應(yīng)進行時，探針和靶核酸都必須是單鏈的。如果用雙鏈DNA探針進行雜交(包括檢測RNA時)，雙鏈DNA探針在雜交前必須進行變性。本產(chǎn)品就是即用型的DNA探針變性液，專門針對DNA探針在雜交前進行變性處理。

產(chǎn)品特點：
1. 即開即用。
2. 使用方便快捷，可用于核酸雜交。

儲存條件：低溫運輸、-20℃保存、有效期一年。

使用方法：

一、根據(jù)探針和靶分子的不同，分別按下面不同情況計算雜交分子的Tm 值
1. 對 DNA-DNA雜交，其Tm = 81.5 + 16.6×log10[Na+] + 0.41×GC%–500/L
說明：L是探針或靶分子的長度(用兩者中zuì短的一個)
 GC%是探針或靶分子中的GC 百分比(用兩者中zuì短的一個)
 Na+濃度是超級雜交液中Na+的濃度，為0.75 M，16.6×log10[Na+]=(-2.07)
2. 對 DNA-RNA雜交，其Tm 值比DNA-DNA的Tm 值要高10-15℃。
3. 對 RNA-RNA雜交，其Tm 值比DNA-DNA的Tm 值要高20-25℃。
4. 對 Oligo探針雜交，Tm=GC 數(shù)量×4℃+AT 數(shù)量×2℃。

二、確定zuì佳雜交溫度(預(yù)雜交溫度跟雜交溫度應(yīng)該一樣)
1. 對于大于200bp的DNA-DNA雜交，zuì佳雜交溫度一般比Tm低15-25℃，一般選擇68℃。
2. 對 RNA-RNA或DNA-RNA雜交，zuì佳雜交溫度一般比Tm低15-25℃。
 如果這樣計算出的雜交溫度很高(如高于70℃)，則RNA 容易降解，所以zuì好選用含甲酰胺的超級雜交液(超級雜交液B型)，以便能在42℃完成雜交。
3. 對 Oligo探針的雜交，zuì佳雜交溫度一般比Tm低5℃。由于Oligo 較短，更容易受各種因素影響(如錯配率、修飾堿基比例等)，所以zuì佳溫度需要適度摸索和優(yōu)化。

三、確定洗膜溫度
一般使用0.1×SSC做洗膜液，在此條件下的zuì佳洗膜溫度比Tm低5-12℃，一般情況下可以在55℃進行洗膜。Oligo探針可以室溫洗膜。

四、預(yù)雜交步驟
 預(yù)雜交就是用不含探針的超級雜交液跟印跡膜進行孵育，其目的是用所含的非特異性DNA分子(鮭精DNA或小牛胸腺DNA)及其它高分子化合物將印跡膜上會非特異地吸附探針分子的位點封閉，否則這些位點會吸附標記的探針，造成高背景。
1. 將結(jié)合了靶分子的硝酸纖維素印跡膜或尼龍印跡膜浸泡于自備的6×SSC溶液中，使其充分濕潤。
2. 將濕潤的印跡膜置于一塑料雜交袋中(塑料袋zuì好預(yù)先封口，再剪掉一角，留一個小口)，按每平方厘米印跡膜加0.2mL超級雜交液的比例沿小口加入超級雜交液，然后用塑料封口機將口封牢。
3. 將此塑料袋浸沒入溫度設(shè)定在zuì佳雜交溫度的恒溫水浴中或雜交爐中，保溫1-2小時，延長到12-16小時亦可。注意保溫過程中塑料袋應(yīng)在不停的搖動狀態(tài)中，使超級雜交液與印跡膜充分接觸。

五、雜交步驟
1. 如果標記的探針是雙鏈核酸，則需經(jīng)變性處理。具體操作是：根據(jù)探針濃度和雜交所需探針的量計算出所需的探針體積，取出所需體積的探針到一干凈的硅化的塑料離心管中，加入等體積的本產(chǎn)品，吹打混勻后室溫放置5分鐘變性后，將探針樣品放入冰浴中冷卻，加入0.05倍體積的自備的1 M的Tris-Cl溶液(pH7.2)以及等體積的自備的0.4 M的HCl溶液。
將探針樣品保存在冰浴中直至需要。如果是單鏈DNA或RNA探針，則不需變性，直接使用。
2. 將單鏈探針或變性后的雙鏈探針加入到完成了預(yù)雜交的雜交袋中(先用剪刀剪一小口，加入探針后用熱封機封口)。探針的加入量視探針標記效率而定，一般要求終濃度不能低于1-2 ng/mL。如果檢測基因組中的單拷貝基因，探針的加入量應(yīng)加大，而對于檢測克隆的基因片段，則探針的量可減少。如果是放射性探針，應(yīng)將此塑料袋套在另一塑料袋之中，以避免雜交袋發(fā)生遺漏、污染工作環(huán)境。
3.在選定的雜交溫度下繼續(xù)保溫，時間一般為6-12小時。

六、洗膜步驟。
 注意在下面的所有操作過程中，一定不要使印跡膜干燥。此步是將與印跡膜非特異結(jié)合的探針分子洗去而只留下特異結(jié)合的探針分子。由于非特異性雜交的雜交分子解鏈溫度較低，熱穩(wěn)定性較差，在一定的溫度和較低的離子強度下，即可洗掉。
1.雜交完畢，取出塑料袋，剪去一角，倒出所有的含探針的雜交液。此含探針的雜交液可以多次使用再倒棄。
2. 剪開雜交袋，用鑷子取出印跡膜，浸沒于大量的2×SSC(含0.5 % SDS)溶液中，室溫下振蕩漂洗15分鐘。
3. 重復(fù)上步操作一次。
4. 將印跡膜轉(zhuǎn)移至0.1×SSC(含0.1% SDS)溶液中，在計算好的洗膜溫度下振蕩漂洗30分鐘至1小時。
5. 重復(fù)上步操作一次。如果是同位素標記探針，則需要重復(fù)至用蓋革計數(shù)器在無核酸區(qū)域檢測不出放射信號為止。
6. 將印跡膜轉(zhuǎn)移到濾紙上，吸去表面液體后印跡膜即可用于后續(xù)檢測。

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BTN90603C 隨機引物法DNA探針地gāo辛標記試劑盒 5次
BTN120653B 填入法DNA末端標記試劑盒(生物素標記dUTP) 5次
BTN100812 BLOTTO溶液 250mL
BTN91104A Denhardt溶液(同位素探針) 250mL
BTN80915B 超級雜交液(含50%甲酰胺) 100mL
BTN130908 鯡魚精DNA溶液 1mL
BTN120643 硫酸葡聚糖 1g
BTN131117 DNA包被溶液 250mL

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名稱：PCR法DNA探針生物素標記試劑盒
貨號：BTN90604B
規(guī)格：5次
PCR標記的原理是用帶標記的dNTP進行PCR，zuì后得到的PCR產(chǎn)物將帶有標記，可以直接用于雜交試驗。其原理示意圖如下：


產(chǎn)品特點：
1.一站式，本試劑盒提供經(jīng)過優(yōu)化的試劑，不需要用戶自己摸索。
2. 足夠10次50μl體系的常規(guī)PCR(用于制備標記反應(yīng)的模板和設(shè)置對照反應(yīng))和5次50μl體系的標記反應(yīng)。
3.一次標記可以得到μg級的雙鏈DNA探針或約700ng的單鏈DNA探針，足夠多次雜交實驗用。
4. 既可用于制備雙鏈探針，也可以用于單鏈探針。
5. 90604A需自備含標記核苷酸的dNTP，90604B和90604C分別含生物素和地gāo辛標記的底物。自備的標記包括fluorescein-dUTP、hydroxycoumarin-dUTP、resorufin-dUTP和aminoallyl-dUTP等。
6. 本產(chǎn)品得到的探針參入率一般為4-5%(每100個核苷酸中有4-5個將帶有非同位素標記)，有效降低了空間阻礙，檢測效果zuì佳。
7.可以用于Southern和Northern Blot、原位雜交、菌落和斑點印跡雜交等分析。

試劑盒組成：

成分	規(guī)格
2×標記專用PCR Mix	500μl
dNTP，2mM each	50μl
含Biotin-11-dUTP的dNTP	25μL(僅B有)
含DIG-11-dUTP的dNTP	25μL(僅C有)
超純水	1ml
說明書	1份

注：標記專用PCR Mix不含dNTP。

儲存條件：低溫運輸，-20℃保存，有效期一年。

使用方法：

一：準備工作
1. 按常規(guī)的方法設(shè)計PCR引物，使探針長度在400-800bp之間。過短則標記參入少，探針雜交信號強度減弱；過長則非特異雜交增加，背景變強。
2. 根據(jù)PCR引物優(yōu)化PCR條件。
3. 由于標記的dNTP比較珍貴，所以本試劑盒不推薦以基因組DNA或其他復(fù)雜DNA為模板直接進行PCR標記，而是建議采取下述的兩步法標記來提高成功率，即先制備非標記PCR產(chǎn)物，再以之為模板制備標記的PCR產(chǎn)物。
二：非標記PCR產(chǎn)物的制備
4. 設(shè)置50μL PCR的反應(yīng)體系：

成份	用量
2×標記專用PCR Mix	25μl
dNTP，2mM each	5μl
自備的探針引物一(10pmol/μL)	1μL(10μM)
自備的探針引物二(10pmol/μL)	1μL(10μM)
自備的模板DNA	1μg基因組DNA或1ng質(zhì)粒DNA
超純水	補到50μL

5. 按已經(jīng)優(yōu)化的PCR參數(shù)進行PCR。
6.電泳檢測和膠回收所需的PCR產(chǎn)物，并定量。用10 pmol引物一般能得到1μg左右的PCR產(chǎn)物(具體取決于PCR產(chǎn)物的長度)。注意：zuì好采取膠回收而不是PCR回收以避免殘留引物干擾后續(xù)的標記PCR。
三：標記PCR反應(yīng)(zuì好做一個不加標記的對照用于定量)
說明：在設(shè)置下面反應(yīng)時，如果加一種引物，就得到單鏈標記的PCR產(chǎn)物；如果加兩種引物，則得到雙鏈標記的PCR產(chǎn)物。由于雙鏈PCR探針在雜交前雖然要變性成單鏈后使用，但雜交時變性的雙鏈彼此還會復(fù)性，這種復(fù)性會與探針-靶DNA雜交反應(yīng)相競爭，降低雜交效率，因此強烈推薦使用單鏈標記的DNA探針。

成份	樣品	對照
2×標記專用PCR Mix	25μl	25μl
含Biotin-11-dUTP的dNTP或 含DIG-11-dUTP的dNTP或 自備的含其他標記dUTP的dNTP	5μl	不加
dNTP，2mM	不加	5μl
雙鏈標記：探針引物一和引物二 單鏈標記：探針引物一或引物二	每種50 pmol 一種50 pmol	每種50 pmol 一種50 pmol
上步膠純化所得PCR產(chǎn)物 (單鏈標記可用100ng)	10 ng	10 ng
超純水	補到50μL	補到50μL

 注意：本試劑盒提供的dNTP混合物中，標記底物與非標記底物的比例已經(jīng)進過優(yōu)化，如果自備標記dUTP，其與dTTP的zuì佳比例需要優(yōu)化，標記不同，比例不同。對DIG-11-dUTP，zuì佳比例1：3；對BrdUTP，zuì佳比例為1：1。
7. 按第5步的PCR參數(shù)進行標記PCR，但需要進行下列修改：一是循環(huán)數(shù)增加到35-55個循環(huán)。由于模板為純化后的PCR產(chǎn)物，探針對擴增長度完整性要求不高(長度不均的探針由于能形成網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)，效果反而更好)，所以可以增加循環(huán)數(shù)；二是延伸時間增加15秒，因為標記dUTP參入到DNA的速度比常規(guī)的dTTP慢；三是降低復(fù)性溫度5-7℃，因為標記核苷酸參入到DNA后，新模板的Tm值將降低。
8. 標記探針的定量：取標記反應(yīng)和對照反應(yīng)的產(chǎn)物1-5μl，在瓊脂糖凝膠上跟濃度已知的DNA marker一起電泳，并判斷探針的濃度。由于標記反應(yīng)的PCR產(chǎn)物中額外帶有非同位素的配體(生物素，地gāo辛等)、因此其泳動速度將慢于非標記PCR產(chǎn)物(但同位素標記不能用此法)。
 注意：如果擴增的是單鏈DNA探針，其結(jié)合EB的能力遠低于雙鏈DNA(EB是嵌合到雙鏈堿基對之間的，而單鏈DNA沒有堿基對，只有一些局部區(qū)域折疊形成的有限雙鏈區(qū)，因此能結(jié)合的EB很少)，因此EB染色的強弱不能準確反應(yīng)DNA的濃度，可以采用銀染定量(跟marker比較)。一般100ng模板按上述條件經(jīng)過單鏈PCR擴增可得到700ng左右探針。
9. 剩余的PCR標記產(chǎn)物可以不經(jīng)過純化，直接加入(對單鏈PCR探針)雜或加熱變性并急冷后加入(對雙鏈PCR探針)到雜交液中使用。如果暫時不用請放-20℃長期保存。如果需要純化，請使用乙酸銨/乙醇沉淀法。

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