SY0038 熱啟動(dòng)高保真酶

熱啟動(dòng)高保真酶的品牌是百奧萊博,是優(yōu)質(zhì)的核酸擴(kuò)增(PCR)產(chǎn)品,本制品用于科研試驗(yàn),我公司專注于核酸擴(kuò)增(PCR)產(chǎn)品的研發(fā)、生產(chǎn)和供應(yīng),為您提供的熱啟動(dòng)高保真酶質(zhì)量可靠,批間差小,且價(jià)格公道,熱切盼望您選購(gòu)我們的產(chǎn)品。...
特別提示:包括熱啟動(dòng)高保真酶在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實(shí)驗(yàn),嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:熱啟動(dòng)高保真酶
英文名稱:HotStart Pfu DNA Polymerase
產(chǎn)品貨號(hào):SY0038
產(chǎn)品規(guī)格:100U
HotStart Pfu DNA Polymerase在Pfu DNA Polymerase的基礎(chǔ)上添加了在常溫下能夠抑制5’→3’聚合酶活性和3’→5’外切酶活性的兩種單克隆抗體,可進(jìn)行高特異性的熱啟動(dòng)(Hot Start)PCR,擴(kuò)增產(chǎn)物為平端。Pfu DNA Polymerase是經(jīng)過(guò)基因工程改造的,新一代超保真DNA聚合酶,具有高的擴(kuò)增效率和廣泛的模板適應(yīng)性,可用于幾乎所有PCR反應(yīng)。其行進(jìn)性 (processivity)得到了大幅度提升,即使是非常復(fù)雜的模板,也能準(zhǔn)確快速的完成反應(yīng)。其錯(cuò)配率是普通Taq酶的1/52,是Pfu酶的1/6;且擴(kuò)增速度可以達(dá)到15秒/kb。
本產(chǎn)品中附帶的5×HS Pfu buffer對(duì)于簡(jiǎn)單或復(fù)雜模板、短片段或長(zhǎng)片段PCR擴(kuò)增都具有良好的適應(yīng)性。緩沖液中已經(jīng)含有10 mM Mg2+ (1×終濃度為2 mM),可以使用產(chǎn)品中提供的DMSO/MgSO4對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化。另外,產(chǎn)品中附帶的PCR Enhancer可有助于高GC含量片段的擴(kuò)增。
產(chǎn)品組份:
5×HS Pfu buffer(with 10 mM MgSO4):1.25 ml
25 mM MgSO4:1 ml
dNTP Mix(10 mM each):100 μl
HS Pfu DNA Polymerase(1 U/μl):100 μl
5×PCR Enhancer:500 μl
DMSO:100 μl
10×Loading buffer:1.25 ml
活性定義:用活性化的大馬哈魚精子DNA作為模板/引物,74℃ 30分鐘內(nèi),攝入10 nmol的全核苷酸為酸性不溶物的活性定義為1個(gè)活性單位(U)。
儲(chǔ)存條件:-20℃
質(zhì)量控制:
核酸外切酶殘留檢測(cè):10 U本品和0.6 μg λ-HindⅢ在74 oC下孵育1小時(shí),DNA的電泳譜帶不發(fā)生變化。
核酸內(nèi)切酶殘留檢測(cè):10 U本品和0.6 μg Supercoiled pBR322 DNA在74 oC下孵育1小時(shí),DNA的電泳譜帶不發(fā)生變化。
大腸桿菌殘留DNA檢測(cè): 50 μl體系中,加入2U本品,以ddH2O為模板,擴(kuò)增E.coil 16s rDNA基因。35個(gè)循環(huán)后擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1% 瓊脂糖凝膠電泳,EB染色,無(wú)擴(kuò)增條帶。
功能檢測(cè)1:50 μl PCR體系中加入1U本品,以100 ng人基因組DNA為模板擴(kuò)增α-1-antitrypsin基因。30個(gè)循環(huán)后取10% PCR產(chǎn)物進(jìn)行1% 瓊脂糖凝膠電泳,EB染色,觀察到單一的8.2 kb條帶。
功能檢測(cè)2:50 μl PCR體系中加入1U本品,以10 ng λDNA為模板擴(kuò)增30個(gè)循環(huán),取10% PCR產(chǎn)物進(jìn)行1% 瓊脂糖凝膠電泳,EB染色,觀察到單一的15 kb條帶。
使用方法:
1. 所有操作請(qǐng)?jiān)诒线M(jìn)行,各組分解凍后請(qǐng)充分搖勻。為了防止HS Pfu DNA Polymerase的校對(duì)活性降解引物,請(qǐng)將聚合酶zuì后加入反應(yīng)體系中。各組分使用完畢后及時(shí)放回-20℃。5×HS Pfu buffer請(qǐng)勿長(zhǎng)時(shí)間敞口放置。
| ddH2O | to 50 μl |
| d5×HS Pfu buffer (with 10 mM MgSO4) | 10 μl |
| d25 mM MgSO4a |
optio |
| ddNTP Mix(10 mM each)b | 1 μl |
| dDMSOc |
optio |
| d5×PCR Enhancerd |
optio |
| d模板DNAe |
optio |
| dForward Primer(10 μM) | 2μl |
| dReverse Primer(10 μM) | 2 μl |
| HS Pfu DNA Polymerase(1 U/μl)f | 1 μl |
【注】:
a. 對(duì)于大多數(shù)PCR反應(yīng),Mg2+zuì佳終濃度為1.5-2 mM。體系中已含有終濃度為2 mM Mg2+,如有需要,可用25 mM MgSO4,以0.2-0.5 mM為間隔向上摸索Mg2+zuì佳使用濃度。
b. 請(qǐng)勿使用dUTP和帶有尿嘧啶的引物或模板。
c. 擴(kuò)增子GC含量>60%時(shí)加入終濃度3%的DMSO有可能會(huì)有助于擴(kuò)增。
d. 推薦僅當(dāng)擴(kuò)增子GC含量>60%且優(yōu)化條件也無(wú)法正常擴(kuò)增時(shí)使用;可能會(huì)降低保真度。
e. 不同模板zuì佳反應(yīng)濃度有所不同,下表為50 μl反應(yīng)體系推薦模板使用量:
| 模板種類/擴(kuò)增長(zhǎng)度 | <1 kb | 1 kb~10 kb | >10 kb |
| 基因組DNA | 50 ng~250 ng | 100 ng~300 ng | 150 ng~400 ng |
| 質(zhì)粒或病毒DNA | 10 pg~20 ng | 10 pg~20 ng | 1 ng~30 ng |
| cDNA | 1~5 μl(不超過(guò)PCR反應(yīng)總體積的1/10) | ||
f. 推薦的酶的終濃度為1U/50 μl反應(yīng)。然而,根據(jù)擴(kuò)增子的長(zhǎng)度和復(fù)雜程度不同,可將HS Pfu DNA Polymerase在0.5-2U/50 μl反應(yīng)之間進(jìn)行優(yōu)化。但請(qǐng)勿超過(guò)2U/50 μl,尤其當(dāng)擴(kuò)增子長(zhǎng)度大于5 kb時(shí)。HS Pfu DNA Polymerase具有較強(qiáng)的校對(duì)活性。如擴(kuò)增產(chǎn)物需要進(jìn)行TA克隆,加A之前必須進(jìn)行DNA純化。
2. 推薦PCR反應(yīng)條件:
| 循環(huán)步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
| 預(yù)變性a | 95℃ | 30 sec~3 min | 1 |
| 變性b | 95℃ | 5~10 sec | 25~35循環(huán) |
| 退火c | 45℃~72℃ | 10~30 sec | |
| 延伸d | 72℃ | 15~30 sec/kb | |
| 徹底延伸 | 72℃ | 5~10 min | 1 |
【注】:
a. 推薦大多數(shù)模板的預(yù)變性溫度為95℃,時(shí)間為:質(zhì)?;虿《綝NA,30 sec,基因組2 min,cDNA 3 min;對(duì)于高GC含量模板,預(yù)變性溫度需提升至98℃,變性時(shí)間為2~4 min;對(duì)于超過(guò)10 kb的擴(kuò)增子,預(yù)變性溫度需降低至92℃,變性時(shí)間不超過(guò)2 min。
b. 對(duì)于大多數(shù)模板在95℃變性時(shí)間設(shè)為5~10 sec即可。對(duì)于高GC含量模板,變性溫度需提升至98℃;對(duì)于超過(guò)10 kb的擴(kuò)增子,變性溫度需降低至92℃,并延長(zhǎng)變性時(shí)間至15 sec。
c. HS Pfu DNA Polymerase能夠促進(jìn)模板和引物退火。一般來(lái)說(shuō),退火溫度設(shè)置為引物Tm值±3℃范圍內(nèi)之間即可。如果需要,可以建立一個(gè)溫度梯度反應(yīng)去尋找引物模板結(jié)合的zuì適溫度。退火時(shí)間太長(zhǎng)可能導(dǎo)致擴(kuò)增產(chǎn)物在膠上呈現(xiàn)彌散狀。因此,推薦退火時(shí)間設(shè)置為10 sec即可。對(duì)于一些困難模板,退火時(shí)間可在10~30sec之間調(diào)整。
d. 對(duì)于大多數(shù)擴(kuò)增反應(yīng),延伸過(guò)程可在72℃進(jìn)行。對(duì)于超過(guò)10 kb的擴(kuò)增片段,需降低延伸溫度至68℃。延伸時(shí)間取決于擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度和模板的復(fù)雜性。使用質(zhì)粒等復(fù)雜程度較低的DNA做模板時(shí),可使用15 sec/kb的延伸時(shí)間;使用基因組
cDNA等復(fù)雜程度較高的DNA做模板時(shí),延伸時(shí)間應(yīng)為30 sec/kb。太長(zhǎng)的延伸時(shí)間會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增增加,因此延伸時(shí)間請(qǐng)勿超過(guò)30 sec/kb。
3. 長(zhǎng)片段PCR指南:
*使用高質(zhì)量的模板;
*使用長(zhǎng)引物。將引物加長(zhǎng)至Tm值68~72℃,把退火/延伸溫度合并為68℃。這樣可以顯著提高擴(kuò)增特異性;
*適當(dāng)提高酶量,但50μl反應(yīng)體系內(nèi)不要超過(guò)2 U;
*添加DMSO,以1%的濃度遞增。調(diào)整范圍為0%~6%;
*推薦反應(yīng)條件設(shè)置:
| 循環(huán)步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
| 預(yù)變性 | 92℃ | 2 min | 1 |
| 變性 | 92℃ | 5~10 sec | 25~35循環(huán) |
| 延伸 | 68℃ | 15~30 sec/kb | |
| 徹底延伸 | 68℃ | 5~10 min | 1 |
4. 高GC含量模板PCR指南:
*使用高質(zhì)量的模板;
*提高變性溫度至98℃;
*添加DMSO,以1%的濃度遞增。調(diào)整范圍為0%~8%;
*添加5×PCR Enhancer;
*推薦反應(yīng)條件設(shè)置:
| 循環(huán)步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
| 預(yù)變性 | 98℃ | 3 min | 1 |
| 變性 | 98℃ | 10 sec | 25~35循環(huán) |
| 退火 | 45℃~72℃ | 10~30sec | |
| 延伸 | 72℃ | 15~30 sec/kb | |
| 徹底延伸 | 72℃ | 5~10 min | 1 |
引物設(shè)計(jì)注意事項(xiàng):
1)引物3’端zuì后一個(gè)堿基zuì好為G或者C;
2)引物3’端zuì后8個(gè)堿基應(yīng)避免出現(xiàn)連續(xù)錯(cuò)配;
3)引物3’端盡量避免發(fā)夾結(jié)構(gòu)出現(xiàn);
4)引物的Tm值調(diào)整至55℃-65℃之間。
5)引物額外附加序列,即與模板非配對(duì)序列,不應(yīng)參與引物Tm值計(jì)算;
6)引物的GC含量控制在40%-60%之間;
7)正向引物和反向引物Tm值以及GC含量盡可能一致。
根據(jù)您的關(guān)注的熱啟動(dòng)高保真酶,您可能還對(duì)以下產(chǎn)品有需求:
名稱:PCR Mix染料
貨號(hào):BTN131212
規(guī)格:10mL
本產(chǎn)品可加入到PCR反應(yīng)液中,使PCR產(chǎn)物可直接上樣電泳,其分子量相當(dāng)于50bp大小的DNA片段,不干擾觀察。
注:本產(chǎn)品不是PCR熒光染料,是一類可見(jiàn)光染料(類似電泳用的溴酚藍(lán),二甲苯藍(lán)等指示劑)
儲(chǔ)存條件:低溫運(yùn)輸和-20℃保存、有效期一年。
名稱:可逆型Taq DNA聚合酶抑制劑
貨號(hào):BTN60901
規(guī)格:0.3mL
Taq DNA聚合酶是進(jìn)行PCR的zuì常用工具酶,但是由于它在常溫下還是具有部分活性,所以經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)非特異的擴(kuò)增產(chǎn)物,尤其是當(dāng)PCR反應(yīng)體系中有大量非特異DNA存在的時(shí)候。目前zuì常見(jiàn)的解決方法是使用抗Taq DNA聚合酶的抗體和使用經(jīng)過(guò)化學(xué)修飾的熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶(如AmpliTaq Gold),但前者的缺點(diǎn)是加熱后抗體會(huì)不可逆失活,后者的缺點(diǎn)是需要預(yù)熱處理使酶激活。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1.可逆抑制Taq DNA聚合酶的活性,即常溫抑制Taq酶活性,在45℃以上抑制功能喪失,當(dāng)溫度降低到45℃以下后,抑制活性又得以恢復(fù)。
2. 耐熱,產(chǎn)品本身為非蛋白質(zhì)試劑,遠(yuǎn)比Anti-Taq抗體穩(wěn)定,便于保存和運(yùn)輸。
3. 使用簡(jiǎn)單,在加Taq酶前將本產(chǎn)品按PCR反應(yīng)體積的1/10直接加入即可。
4.適用范圍廣,除Taq DNA聚合酶外,還可用于抑制其他DNA聚合酶的活性,如:Tth pol、Stoffel片段、Tfl pol、Tbr pol等。而一種酶的抗體一般對(duì)另一種酶的活性沒(méi)有抑制作用。
5.與后續(xù)的RT-PCR兼容。
儲(chǔ)存條件:低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
在加入Taq或Tth DNA聚合酶之前,按PCR反應(yīng)終體積1/10的比例將本產(chǎn)品加入到反應(yīng)體系中混勻,然后再加入DNA聚合酶,啟動(dòng)PCR反應(yīng)。
名稱:cDNA鏈合成試劑盒(RNase H-)
貨號(hào):YT395
規(guī)格:10次
本品是一種采用了經(jīng)過(guò)改造和優(yōu)化的M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶(RNase H-),用于在總RNA、mRNA等RNA模板的基礎(chǔ)上反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生cDNA鏈的試劑盒。本試劑盒包含了進(jìn)行cDNA鏈合成所需的各種試劑。
采用本試劑盒可以合成長(zhǎng)達(dá)13kb的cDNA鏈。在采用M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶(RNase H-)的情況下,由于缺失了RNase H,RNA和DNA雙鏈復(fù)合物中的RNA不會(huì)被降解,這樣反轉(zhuǎn)錄出來(lái)的cDNA的長(zhǎng)度就會(huì)更長(zhǎng),并且產(chǎn)量更高。
試劑盒中提供了RNase Inhibitor,確保在反轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的RNA不會(huì)被RNA酶所降解并取得較好的反轉(zhuǎn)錄效果。
試劑盒還提供了Oligo(dT)18和random hexamer這兩種引物,前者適合用于帶有Poly(A)尾的mRNA的反轉(zhuǎn)錄,后者進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄時(shí)不需要poly(A)尾。也可以自行采用基因特異性引物進(jìn)行cDNA鏈的合成。
試劑盒中提供的Co
使用本試劑盒合成的鏈,可以直接用于后續(xù)的常規(guī)PCR、real-time PCR、cDNA第二條鏈的合成等。
本試劑盒用于體積為20微升的cDNA鏈合成反應(yīng)時(shí)足夠進(jìn)行10個(gè)cDNA鏈樣品的合成。
產(chǎn)品組份:
M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶(RNase H-)(200U/μl)————2000U
Reaction Buffer(5X)———————————50μl
RNase Inhibitor(20U/μl)————————10μl
dNTP Mix(10 mM each)——————————20μl
Oligo(dT)18 Primer(0.5μg/μl)—————10μl
Random Hexamer Primer(0.2μgμl)————10μl
Co
Co
DEPC-treated Water———————————0.2ml
儲(chǔ)存條件:-20℃。
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